一、 学历层次
毕业证所代表的学历层次是最直接区分两者不同的标志，全日制大专毕业证属于本科层次学位教育系统的证书，通过完成学校内规定的学年学时获得。而函授大学毕业证则主要面向已经在社会上打拼的有工作人群，走通信或网络辅导教育获得相关学位证书。
二、 学习时间
全日制大专毕业证由于需要在学校内完成相应的学业，通常需要耗费3-4年的时间来完成。而函授大学毕业证则依据个人学习进度不同，在2-6年的范围内，完成学习任务并通过考试就能够获得毕业证书。
三、 学习方式
除了学历层次和学习时间之外，学习方式也是两者的区别之一。全日制大专毕业证的主要学习方式则是在为期几年的规定时间内参加课程，上课时间通常为全日制，包括教室授课以及实验课程等。而相较于全日制大专，函授大学毕业证则是主要采用远程教育和在线学习的形式进行，学生可以根据个人需要自由设定学习时间和地点。
四、 学科设置
虽然两者都是工科类相关专业，但具体要求各自知识点却有所不同。全日制大专毕业证针对同等学力的人群，希望能够通过一般阶段性考试检测和检验学员们的学业水平并提高其综合素质排名;而函授大学毕业证则针对多类型人群考查其发展潜力和职业资格素养等不同方面，依据该人群的特殊需求与工作条件来设置课程和考试科目。
